病菌

巴西龟对人类来说，第一个危害就是巴西龟所携带的沙门氏病菌，巴西龟也是传播沙门菌的主要罪魁祸首，它体内带有着百分之八十五的沙门氏菌，而且幼龟中，沙门氏菌更多，而且经过反复研究论证，巴西龟中所携带的沙门氏菌是会传染给人类的，给人类带来危害。这一种病菌会对老年人，孕妇和小朋友们的健康有危害，对于体质差的人来说，沙门氏菌也是十分危险的。所以，家中如果有饲养巴西龟的人，一定要注意不要让孕妇和孩子接触巴西龟，接触巴西龟之后也一定要洗手，清洁干净。

破坏生态

可能导致本地龟灭绝，已被列入世界自然保护联盟公布的全球100种最具威胁的外来物种之一，其食性杂，栖息环境多样，繁殖、竞争和耐受能力强。其在野生环境中竞争能力极强，侵占本土物种栖息地，导致本土龟鳖类濒危或灭绝，破坏当地食物网，造成物种单一化，极大地危害自然生态平衡。致本土龟基因流失，由于巴西龟能够与本土其他淡水龟类杂交繁殖，导致本土淡水龟类的基因流失，也大大影响本土淡水龟类的遗传多样性，由于放生等因素，巴西龟经常会在某一个水域内，在数量上占据绝对优势，这增加了巴西龟与本土淡水龟杂交繁殖的可能性。长此以往，本土龟的基因将不再纯正，慢慢的就可能导致灭亡，造成物种单一化。在香港和台湾，科学调查证明巴西龟是名副其实的“生态杀手”。巴西龟引进到台湾不到20年，已经在台湾定居繁殖建立族群，成为台湾最普遍的龟类。