工厂店和旗舰店具有以下区别，价格区别，旗舰店产品价格较高，工厂店产品价格要低。款式区别，旗舰店通常款式新颖还少，工厂店的特色是旧款断码款较多。质量区别，旗舰店质量有保证，可以享受良好的售后服务，工厂店不一定能买到正品，缺乏售后服务。